PCR定量試劑盒在工業(yè)中的應(yīng)用主要存在一個(gè)方法驗(yàn)證的問題,尤其是靈敏度的驗(yàn)證。靈敏度不夠,就會(huì)發(fā)生漏檢。另外,PCR所直接面對(duì)的樣本是DNA,而非病原菌或DNA,因此還需要做DNA抽提,這也是要注意的。
藥典規(guī)定,生物藥廠的主細(xì)胞庫、工作細(xì)胞庫、生產(chǎn)終末細(xì)胞、檢定細(xì)胞、病毒種子批和病毒收獲液、細(xì)胞培養(yǎng)相關(guān)材料如培養(yǎng)基、胰酶、臨床治療用干細(xì)胞和免疫細(xì)胞等,都必須不含支原體。
因此,如能采用PCR檢測支原體并替代藥典方法,還是能節(jié)省很多時(shí)間和精力。但PCR定量試劑盒的驗(yàn)證需要完整的方法。靈敏度驗(yàn)證是一個(gè)重要方面。靈敏度不夠,就會(huì)發(fā)生漏檢。
具體驗(yàn)證可使用10CFU的支原體靈敏度標(biāo)準(zhǔn)品,它一般為凍干粉形式,需要用待測樣本的樣本基質(zhì)(需保證里面不含支原體)來復(fù)溶,再進(jìn)行DNA抽提以及PCR檢測。如檢測的電泳有條帶,或者qPCR檢測后的Ct值小于40,即表明檢測成功。
因此,在選用支原體PCR法檢測來替代藥典方法時(shí),需要考慮如下兩個(gè)方面:
一是要使用符合歐洲藥典要求,經(jīng)過驗(yàn)證的支原體檢測試劑盒,二是自我驗(yàn)證,即確認(rèn)所用的樣本基質(zhì)對(duì)于該試劑盒方法是合適的,并且操作過程是正確的。小規(guī)模的室內(nèi)驗(yàn)證通常需要采用三個(gè)不同批次的試劑盒,然后加入10CFU的標(biāo)準(zhǔn)品,做復(fù)孔(通常是8個(gè)復(fù)孔),并且至少選擇3個(gè)支原體物種進(jìn)行驗(yàn)證。
有的支原體標(biāo)準(zhǔn)品廠家會(huì)提供CFU與基因拷貝數(shù)的比值,以方便二者的換算。因?yàn)?0CFU只能確定PCR定量試劑盒能夠達(dá)到的檢測限在10CFU以下,但無法具體確定靈敏度的數(shù)值。帶DNA拷貝數(shù)標(biāo)定的基因組DNA標(biāo)準(zhǔn)品則可進(jìn)一步確定檢測限的數(shù)值。